为了鼓励更多优秀学生报考我校研究生，学校和学院出台优惠政策对研究生给予资助，具体举措如下：
1、2013年推免生和第一志愿报考广东海洋大学的考生，凡被正式录取者，入学后由学校一次性奖励1200元。
2、录取为国家计划内非定向的研究生，免交学费，在学期间按月发放普通奖学金400元/月。
3、学院资助（委培生除外）：
水产学院的水产养殖、捕捞学、渔业资源、海洋生物学：发放科研津贴每生300元/月。由学院统筹，在导师科研经费中列支。
海洋与气象学院所有招生专业：发放科研津贴每生500元/月。由学院统筹发放，在导师科研经费中列支。物理海洋学专业优先录取海洋科学、大气科学、海洋技术、数学和物理及相关专业的考生。
农学院的作物遗传育种、作物栽培学与耕作学、植物病理学：发放科研津贴每生300元/月。由学院统筹从在导师科研经费中列支，凡被录取者入校后报销复试来回硬座车票。
食品科技学院各招生专业：在校期间，指导教师给予每人科研津贴100－300元/月。
工程学院招生专业：指导教师给予每人科研资助100－300元/月，费用在导师科研经费中列支。被录取者入学后按火车硬座标准给予报销复试往返路费。
4、学校还设多项奖学金、设立研究生“三助”岗位及国家助学贷款，帮助研究生完成学业。学校奖贷学金项目包括：
①南粤优秀研究生、学校优秀研究生、优秀研究生干部、发表论文奖等每学年评选一次，并发放一定数量的奖金。
②“三助”岗位：学校每年提供一定数量的“三助”岗位供学业成绩较好、家庭经济较困难的研究生勤工助学，300—400元/月。③国家助学贷款：学校协助经济困难学生向银行申请国家助学贷款。